用放射性同位素或非放射性化學物質(zhì)標記探針(待克隆的基因或cDNA的一段同源序列)，同文庫的細菌克隆或噬菌斑作核酸分子雜交，經(jīng)放射自顯影或顯色反應后，可以篩選出含有同探針互補序列的細菌克隆或噬菌斑，然后分析這些重組載體中所插入的DNA片段或cDNA，最后分離出所要的基因或cDNA。 在克隆cDNA時，還可應用噬菌體載體λgtll構建cDNA文庫，這種載體可使插入的cDNA分子翻譯產(chǎn)生蛋白質(zhì)。此時，可用某一蛋白質(zhì)免疫動物得到抗體并標記上同位素或化學物質(zhì)后用作探針，即用蛋白質(zhì)作為探針去篩查cDNA文庫，如果這種抗體能同cDNA文庫中某個噬菌斑產(chǎn)生抗原—抗體結合反應，則這個噬菌體載體中插入的cDNA所編碼的就是用作抗原去免疫動物的蛋白質(zhì)，也就是探針探查的目的基因。